As investigações começaram no Grupo de Combate ao Crime Organizado (GCCO) da Polícia Civil de Rondônia em dezembro de 2011, apurando ações criminosas relacionadas ao tráfico de drogas e financiamento para o tráfico. Na apuração verificou-se vários desdobramentos criminosos e pessoas articuladas para a prática de crimes: falsificação de documentos, estelionato, peculato, corrupção, tráfico de influência, prevaricação e quebra de sigilo funcional e formação de quadrilha.
Identificou-se na quadrilha núcleos interdependentes que agiam para a consecução dos seus objetivos escusos. O núcleo financeiro da quadrilha financiou campanhas políticas, captava recursos, lavava dinheiro, enquanto o núcleo político recebia o financiamento para a campanha e retornava benefícios como nomeações de funcionários fantasmas.
Também foram descobertos golpes de cartões de créditos gerando prejuízos enormes. Durante as investigações ficou constatado que os integrantes adquiriram 7,5 milhões de reais em veículos, 22,5 milhões de reais em imóveis e 3,5 milhões de reais em cotas de empresas, totalizando por volta de 33 milhões de reais em prejuízos.
Foram investigadas 98 pessoas físicas e 27 pessoas jurídicas, gerando para cumprimento nesta data, 229 medidas cautelares, entre mandados de busca e apreensão, prisões preventivas e indisponibilidade de bens.
A organização criminosa tinha tentáculos em Rondônia e mais 8 estados, Acre, AM, MT, CE, RN, DF, SP e PR. A operação foi deflagrada simultaneamente nesta data tendo ações em Rondônia nas cidades de Porto Velho, Nova Mamoré, Guajará-Mirim e Ji-Paraná.
Para a execução da Operação Apocalipse foam mobilizados aproximadamente 80 delegados, 420 agentes e escrvães, 10 peritos, 10 datiloscopistas, cinco médicos legistas, 120 viaturas totalizando 101 equipes.